An der Städtischen Maria-Probst-Realschule waren bis 2021 drei Lernhäuser etabliert. Zum Schuljahr 21/22 wurde das Lernhausmodel, mit der Einführung der mittleren Führungsebene, überarbeitet. Jede Jahrgangsstufe, mit Ausnahme der 10. Klassen, bildet nun ein Lernhaus und wird von einer Lernhausleitung betreut. Die einzelnen Jahrgangsstufen haben spezielle pädagogische Schwerpunkte, die alle Kinder und Jugendliche im Lauf der Jahre durchlaufen. Die Kernfächer werden von einem möglichst konstanten Lehrkräfteteam über die Schulzeit unterrichtet. Ziel ist eine kontinuierliche und persönliche Struktur im Lernprozess. Zudem soll die klassenübergreifende Zusammenarbeit von Schüler*innen innerhalb einer Jahrgangsstufe gefördert werden. Unterstützt wird dies durch eine räumliche Nähe der jeweiligen Klassen. Die 5., 6. und 10. Jahrgangsstufen werden im Gebäude Reutberger Straße, die Jahrgangsstufen 7, 8 und 9 im Gebäude Gotzinger Platz unterrichtet.

Die Farben der  sechs Lernhäuser finden sich auch in unserem Schullogo wieder.